济宁高新区档案馆于2016年9月19日成立，隶属高新区党政办公室管理，与档案管理中心合署办公。2023年2月被省档案局、省档案馆评为“山东省档案工作业务建设先进单位”。现有专业管理人员2人，建筑面积7561.6㎡，场馆配有先进的设备设施，包括中央空调、自动安全监控、门禁系统、档案管理系统、灭菌消毒柜、摄像机、照相机、扫描仪、智能移动式密集架、高压细水雾灭火系统、除湿机及精密空调等现代化先进设备。

区档案馆现有馆藏56个全宗，总计47865卷，案卷排列长度1915米。馆藏主要有文书档案、科技档案、会计档案、企业档案、照片档案、声像档案、多媒体档案和重大活动档案等门类。其中高新区自1991成立以来至2021年44037件328461页的文书档案、疫情防控档案、精准扶贫档案和国企退休职工档案均已全部完成数字化建设，有效地提升了档案的查询利用效率。